Подробное описание работы секвенатора

Описание чипов от PGM

Чип представляет из себя матрицу, как у фотоаппарата, только в вместо пикселей, реагирующих на свет, пиксели реагируют на изменение Ph.
Опрос чипа происходит по строкам и столбцам.

Информация считывается параллельно через четыре аналоговых выхода. Распараллеливание происходит по строкам. Одновременно считываются четыре строки. По мимо этого чип разбит на две части.
Порядок считывания обозначен на картинке:

Переключение строк и столбцов происходит с помощью двух сдвиговых регистров.

К каждому из этих регистров подается clock, reset, и имеется выход из этих сдвиговых регистров. При подаче reset, все D-триггеры обнуляются, в первый загружается единица. Далее по фронту Clk, эта единица перемещается по D-триггерам, опрашивая разные строки или столбцы. После проходов через все D-триггеры, эта единица выходит через выход сигнализируя об окончании регистра. По переднему фронту  clk данные считываются одной половины чипа, по заднему из другой.

К затворам транзисторов, которые лежат в не активной области чипа (куда не попадают реагенты) подведены дорожки, которые выходят наружу, с помощью них можно калибровать сигнал с чипа.

Сигнал с пикселей, проходит через буферы, устройство выборки-хранения, мультиплексор и выходной усилитель.

Имеется три чипа: Ion314, Ion316, Ion318, различающиеся различным количеством пикселей.  Примерно 1,5, 5, и 10 млн пикселей соответственно.

Все чипы совместимы между собой.