SOFT

Интегрировать две программы в одну. Весь интерфейс выполнить по ethernet. Оценить потери при передачи. Наверное надо заменить UDP на TCP.

Сама работа установки подразумевает собой два этапа.
Задачи софта:
1) Передавать настройки на FPGA
2) Выводить оттуда картинку, оценивать загрузку и промывку чипа.
3) Режим секвенирования. Отправлять команды подачи реагентов, регистрировать всплески Ph в лунках чипа.

Обработка информации при секвенировании: 4АЦПх100MSPS = 400МБайт информации с чипа в секунду при разрядности АЦП 8. В идеале иметь 16. Такой поток информации тяжело передавать на комп. Из него необходимо выкинуть информации с пикселей находящиеся в не рабочей области, а также из пустых пикселей. Далее из данных АЦП надо отслеживать события, когда Ph резко возрастает и фиксировать этот пик. Выходные данные должны быть примерно в таком формате: Каждой рабочей лунке на чипе должна соответствовать двух мерный массив. Одна строка в этом массиве — реагент при котором произошло событие; Вторая — максимальное значение АЦП, которое было при этом получено   Эту обработку желательно  проводить на ПЛИС используя память SOC.

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *